Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LARP4-204ENST00000429001 4000 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ACOT9-202ENST00000379295 2768 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01410-201ENST00000424345 2877 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008543.1-201ENST00000344893 3383 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MERTK-207ENST00000616902 3104 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TDRD9-201ENST00000339063 3447 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 CNR2-201ENST00000374472 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 OTUD6B-206ENST00000617869 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 AL109811.1-201ENST00000452378 2682 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP4-12Q9BQ66 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms