Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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COL4A6Q14031 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
COL4A6Q14031 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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