Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CCDC142Q17RM4 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC142Q17RM4 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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