Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTCH1Q13635 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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PTCH1Q13635 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PTCH1Q13635 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PTCH1Q13635 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PTCH1Q13635 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PTCH1Q13635 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC8.83□□□□□ -1
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