Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 MECOM-208ENST00000468789 3691 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
POLR2AP24928 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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