Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PIAS3Q9Y6X2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms