Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX13Q9Y5W8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX13Q9Y5W8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms