Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAPPC1Q9Y5R8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms