Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF6Q9Y4K3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms