Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAD54L2Q9Y4B4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAD54L2Q9Y4B4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms