Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNQ9UQP3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms