Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNX12Q9UMY4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms