Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
EPDR1Q9UM22 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EPDR1Q9UM22 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms