Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEFF2Q9UIK5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEFF2Q9UIK5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms