Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLIP2Q9UDT6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms