Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCLA2Q9P2R7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUCLA2Q9P2R7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms