Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC88CQ9P219 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms