Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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