Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZP8

C1RL, Complement C1r subcomponent-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RLQ9NZP8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1RLQ9NZP8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1RLQ9NZP8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1RLQ9NZP8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1RLQ9NZP8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1RLQ9NZP8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms