Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA3Q9NZ52 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA3Q9NZ52 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms