Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDK12Q9NYV4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms