Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC10Q9NYD6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC10Q9NYD6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms