Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MED9Q9NWA0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED9Q9NWA0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms