Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNTG1Q9NSN8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms