Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms