Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FANCFQ9NPI8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FANCFQ9NPI8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FANCFQ9NPI8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FANCFQ9NPI8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FANCFQ9NPI8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FANCFQ9NPI8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FANCFQ9NPI8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FANCFQ9NPI8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FANCFQ9NPI8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms