Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FZD3Q9NPG1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FZD3Q9NPG1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms