Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPF2Q9HAU5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms