Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRABDQ9H4I3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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