Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA6BQ9H3T3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms