Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNMDQ9H2S6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNMDQ9H2S6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms