Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MTIF3Q9H2K0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTIF3Q9H2K0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms