Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MED28Q9H204 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MED28Q9H204 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms