Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNHG12Q9BXW3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms