Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAF4Q9BUZ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms