Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMCHL2Q9BQD1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMCHL2Q9BQD1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms