Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms