Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3R4Q99570 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3R4Q99570 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms