Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TSNARE1Q96NA8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms