Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SAMD8Q96LT4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms