Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00208Q96KT6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms