Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms