Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZBED3Q96IU2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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