Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms