Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNRQ92752 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNRQ92752 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNRQ92752 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNRQ92752 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNRQ92752 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNRQ92752 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNRQ92752 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNRQ92752 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRQ92752 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRQ92752 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRQ92752 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRQ92752 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRQ92752 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRQ92752 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNRQ92752 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNRQ92752 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNRQ92752 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms