Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF12Q8WXF0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF12Q8WXF0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms