Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSH3Q8TE77 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms