Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
DDX54Q8TDD1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX54Q8TDD1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms