Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET6

CHST13, Carbohydrate sulfotransferase 13, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST13Q8NET6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST13Q8NET6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST13Q8NET6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST13Q8NET6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST13Q8NET6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST13Q8NET6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST13Q8NET6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST13Q8NET6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST13Q8NET6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHST13Q8NET6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms