Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSGALNACT2Q8N6G5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms